توکیو در بخشی از ژاپن به نام دشت کانتو و رو به خلیج توکیو ساخته شدهاست. توکیو در مجاورت استان کاناگاوا، استان چیبا، استان سایتاما و استان یاماناشی قرار گرفتهاست. جزایر اوگاساوارا با وجوداینکه در فاصلهٔ ۱۰۰۰ کیلومتری از جنوب و جنوب شرقی مناطق ویژه توکیو واقع شدهاند، جزئی از توکیو محسوب میشوند و بدین ترتیب توکیو جنوبیترین و شرقیترین استان ژاپن محسوب میشود. مساحت توکیو ۲٬۱۸۷.۰۸ کیلومتر مربع است.