Cryo-electron microscopy نوعی میکروسکوپ الکترونی است برای مطالعه نمونه های زیستی. در این میکروسکوپ امکان کاهش دمای نمونه (با استفاده از نیتروژن مایع) وجود دارد. دلیل استفاده از این میکروسکوپ آن است که برای تصویربرداری از برخی نمونه های زیستی باید نمونه رنگ آمیزی شود که این مسئله به ساختار نمونه آسیبهایی می زند. برای رهایی از این آسیب ها می توان از Cryo-electron microscopy استفاده کرد.